Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SGTAO43765 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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