Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MSI1O43347 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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