Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E2F3O00716 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E2F3O00716 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms