Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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