Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms