Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PATL2C9JE40 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms