Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HACD1B0YJ81 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HACD1B0YJ81 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms