Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCL27Q9Y4X3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCL27Q9Y4X3 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCL27Q9Y4X3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CCL27Q9Y4X3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CCL27Q9Y4X3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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