Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SETD1BQ9UPS6 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms