Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
XCL2Q9UBD3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms