Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms