Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNIH4Q9P003 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms