Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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