Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms