Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms