Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRDM12Q9H4Q4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRDM12Q9H4Q4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms