Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB17Q9H0T7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms