Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL4Q9C0H6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL4Q9C0H6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms