Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM5Q9C035 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms