Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms