Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCO2Q9BYV7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms