Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATA5Q9BWX5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms