Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD2AQ9BW72 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD2AQ9BW72 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms