Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HIRIP3Q9BW71 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms