Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
C2orf88Q9BSF0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms