Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SGIP1Q9BQI5 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms