Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBBP8Q99708 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms