Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PITX2Q99697 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PITX2Q99697 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms