Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
C9orf85Q96MD7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms