Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGF29Q96ES7 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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