Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ECHDC3Q96DC8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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