Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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SPTSSAQ969W0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSAQ969W0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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