Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms