Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
SMIM29Q86T20 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
SMIM29Q86T20 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms