Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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