Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms