Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C15orf39Q6ZRI6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms