Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VSTM1Q6UX27 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms