Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LMBR1LQ6UX01 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms