Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGAP9Q5VTM2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms