Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LACTB2Q53H82 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LACTB2Q53H82 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms