Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GPAT3Q53EU6 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms