Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GREB1Q4ZG55 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms