Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC25A52Q3SY17 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC25A52Q3SY17 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms