Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms