Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC57Q2TAC2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms