Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TSNAXIP1Q2TAA8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms