Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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COL24A1Q17RW2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
COL24A1Q17RW2 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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