Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HIST3H3Q16695 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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