Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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GABRA6Q16445 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GABRA6Q16445 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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